Náttúrustofa Austurlands hefur, fyrir hönd Landsvirkjunnar, frá 2004 framkvæmt fuglarannsókir á áhrifasvæði Kárahnjúkavirkjunar samkvæmt úrskurði ráðherra vegna Fljótsdalsvirkjunnar. Skýrsla sem greinir frá niðurstöðum þessara rannsókna hefur nú verið gefin út af Landsvirkjun.